תנאי הקבלה ללימודים לקראת תואר שני בהנדסת מערכות:

בוגרי תואר B.Sc בהנדסה או במדעים מדויקים (פיזיקה או מדעי המחשב) ממוסד אקדמי מוכר להשכלה גבוהה בארץ או בחו"ל, בממוצע 80 לפחות. 

קבלה על בסיס ניסיון תעסוקתי- מועמדים בעלי 2 שנות ניסיון לפחות, ממועד הזכאות לתואר הראשון וממוצע ציונים של 75-80, שיעברו בהצלחה ראיון אישי עם ראש התוכנית. אפיק קבלה זה אינו חל על מועמדים לתואר שני עם תזה